Untuk mewujudkan visi tersebut, maka Program Studi Akuntansi Fakultas Ekonomi dan Bisnis Islam UIN Alauddin Makassar memiliki misi sebagai berikut:

1. Menyelenggarakan Pendidikan dalam Bidang Ilmu Akuntansi yang Diintegrasikan dengan Ajaran Agama Islam;
2. Mengembangkan Ilmu Akuntansi Berdasarkan Epistemologi Ajaran Islam;
3. Memberikan Landasan Etika dan Moral Terhadap Pengembangan Pengkajian Ilmu Akuntansi;
4. Mengembangkan Sumber Daya Manusia yang Profesional, Tanggap Terhadap Perubahan, Berbasis Teknologi Informasi yang Berlandaskan Ajaran Islam;
5. Menumbuhkembangkan Jiwa Entrepreneur dalam Kajian Teori dan Penelitian Praktek Akuntansi yang Terpadu dengan Ajaran Agama Islam;
6. Melakukan Pengabdian Masyarakat dengan Menerapkan Secara Aplikatif Teori Ilmu Akuntansi Berlandaskan Ajaran Agama Islam

   
    TUJUAN

1. Mewujudkan Program Studi Akuntansi yang unggul dan berdaya saing ditingkat ASEAN pada tahun 2039;
2. Menyelenggarakan pendidikan yang menghasilkan alumni yang memiliki kemantapan akidah, kedalaman spiritual, keluhuran akhlak, keluasan ilmu pengetahuan, dan kematangan profesional dalam bidang akuntansi sesuai kebutuhan stakeholders;
3. Menyelenggarakan berbagai kajian dan pengembangan ilmu akuntansi yang diintegrasikan dengan ajaran agama Islam;
4. Mengadakan penelitian yang dapat menunjang pengembangan disiplin ilmu Akuntansi untuk kebutuhan stakeholders;
5. Menyelenggarakan kerjasama dalam bidang profesi dan entitas bisnis dengan stakeholders baik secara lokal, nasional maupun internasional; dan
6. Melakukan pengabdian masyarakat yang memberikan kontribusi terhadap pengembangan sistem akuntansi yang berlaku dalam berbagai sektor (pemerintahan, bisnis, dan pranata sosial).